Сектор истории был создан с началом организации Горно-Алтайского научно-исследовательского института истории, языка и литературы (ныне НИИ алтаистики им. С.С. Суразакова) в 1952 году. Первым сотрудником, заведующим сектором и ученым секретарем стал П.Е. Тадыев, чуть позже в сектор истории пришел работать С.Я. Пахаев.
Начальный этап научно-исследовательского сектора истории Горного Алтая связан с именами указанных ученых-историков. В последующие годы сектор истории объединил работу историков, археологов, этнографов. С.Я. Пахаев занимался историей Гражданской войны, в своих работах он восстановил картину боевых действий в Горном Алтае, дал периодизацию Гражданской войны, охарактеризовал деятельность Каракорум-Алтайской управы – органа земского самоуправления, действовавшего в условиях правления антибольшевистской власти в Сибири. П.Е. Тадыева, помимо Гражданской войны, интересовали и другие научные темы, связанные с этнической историей алтайцев: история бурханизма, шаманизма, этнический состав и административное устройство коренного населения в дореволюционное время.
Сотрудники сектора истории активно сотрудничали с коллегами из профильных институтов АН СССР, вузов Сибири, Горно-Алтайского пединститута. В научно-редакторском руководстве и непосредственном написании научно-исследовательских работ по истории Горного Алтая принимали участие ведущие специалисты Объединенного Института истории, филологии и философии СО АН СССР (ОИИФФ СО АН СССР). Во второй половине 1960-х гг. заметный вклад в научно-исследовательскую работу института внесли внештатные сотрудники – ученые академических институтов: Г.А. Докучаев, Л.П. Потапов, В.А. Демидов и др.
Итогом исследований по истории Горного Алтая стала коллективная монография «Очерки истории Горно-Алтайской автономной области» (1973 г.). В ней были освещены проблемы, связанные с Октябрьской революцией и Гражданской войной, развитием сельского хозяйства и промышленности, социально-культурной сферы региона в периоды индустриализации и коллективизации, Великой Отечественной войны, послевоенного восстановления и в 1950–1960-е годы. Научным редактором издания стал Л.П. Потапов – известный советский этнограф и историк.
Богатое культурно-историческое наследие Горного Алтая требовало целенаправленного научного изучения. Перед Институтом стояла проблема расширения исследований археологических памятников Горного Алтая. С приходом в ГАНИИИЯЛ археолога А.С. Суразакова Институт начал работу в составе экспедиций ОИИФФ СО АН СССР и Института истории АН СССР. С 1978 г. в связи с организацией археологических экспедиций полевые работы перешли на постоянную основу. На протяжении четверти века под руководством А.С. Суразакова были исследованы курганы скифского времени в Кош-Агачском, Онгудайском, Усть-Канском и других районах Горного Алтая. В итоге был собран массовый археологический материал, позволивший по-новому осветить один из интереснейших периодов истории Горного Алтая.
В 1970-1980-е гг. в поле зрения научных интересов историков Института продолжали оставаться следующие проблемы: этническая история алтайцев; социально-экономические процессы в Горном Алтае в период XVIII – начала XX вв.; установление и укрепление Советской власти; социальная структура алтайского общества в дореволюционный период и ее изменения в годы Советской власти; национально-освободительное движение в Горном Алтае, крестьянские переселения в Горный Алтай в XIX – начале XX вв. Особое внимание уделялось вопросам этнической консолидации алтайского народа, отдельным предметом исследования были их этническая история, народное искусство. Большой вклад в разработку указанных проблем внесли С.Я. Пахаев, Ф.А. Сатлаев, Н.С. Модоров, И.П. Эдоков, Н.В. Екеев.
Сектор истории продолжал сотрудничество с профильными академическими институтами: Институтом истории АН СССР и Институтом истории СО АН СССР. Благодаря этому в Институте регулярно издавались тематические сборники: «Вопросы истории Горного Алтая», «Вопросы истории и этнографии Горного Алтая», «Археологические исследования в Горном Алтае».
Начало следующего этапа исторических исследований в Институте связывается с пополнением новыми кадрами, сменой поколений исследователей и расширением тематики исследований. Во второй половине 1980-х гг. к работе в секторе истории приступили Г.П. Самаев, Н.А. Майдурова, А.А. Иркитова. Результаты научных исследований были изданы в монографиях И.П. Эдокова «Коллективизация в Горном Алтае» (1987), Н.В. Екеева «Социально-экономическое развитие деревни Горного Алтая в 1920-х годах» (1988). Авторы рассмотрели актуальные в отечественной историографии того времени вопросы развития алтайского села в1920–1930-е гг.: вовлечение населения в кооперацию, землеустройство, переход к оседлости, колхозное строительство, культурное строительство. Г.П. Самаев в исследовании «Горный Алтай в XVII – середине XIX вв. Проблемы политической истории и присоединения к России» (1991) подробно показал процесс присоединения Горного Алтая в состав Российского государства.
Большие успехи были достигнуты археологами Института. В середине 1980-х гг. средняя продолжительность полевого сезона археологов составляла в среднем от 1,5 до 2 месяцев. В итоге архив института пополнялся новыми полевыми материалами. В 1986 г. был открыт сектор археологии под руководством А.С. Суразакова. В новом секторе активно работали молодые сотрудники: Л.М. Чевалков, О.В. Ларин, В.А. Кочеев. Полученные в ходе раскопок археологические материалы эпох энеолита и раннего железа, а также древнетюркского времени, значительно расширили научные знания о хозяйстве, культуре, этническом составе населения Горного Алтая указанных эпох. Большое внимание уделялось исследованиям экономики, социальной структуры, мировоззрении раннесредневековых тюркских племенных групп Горного Алтая и сопредельных территорий.
Изменения, которые стали происходить в советском обществе во второй половине 1980-х гг. способствовали началу социологических исследований. В 1989 г. был создан сектор социально-экономических исследований, который возглавила Т.А. Троицкая. Сотрудниками сектора стали изучаться вопросы социально-демографической динамики и качества населения региона.
В 1990-е годы в Институте стали работать новые сотрудники: М.С. Каташев, Н.В. Белоусова (сектор истории), А.В. Эдоков (сектор искусствоведения), О.В. Даровских и Г.Б. Эшматова (сектор социально-экономических исследований). Соответственно расширилась тематика исследований.
В 1997 г. публикуются две монографии Н.А. Майдуровой: «Горный Алтай в годы первой мировой войны (1914–февраль 1917 гг.)» и «Горный Алтай в феврале-октябре 1917 г.». В них представлены социально-экономические и политические процессы в регионе накануне революции 1917 г., особое внимание уделено Алтайской Горной Думе и ее деятельности по организации в пределах Горного Алтая самостоятельной земской единицы. В 1994 г. она опубликовала в двух частях сборник материалов по истории бурханизма.
Значимые результаты были достигнуты Ф.А. Сатлаевым и Н.А. Майдуровой в изучении вопросов социально-экономического развития Горного Алтая в XIX–начале XX вв.: реформа М. Сперанского, административные и аграрные преобразования во второй половине XIX – начале XX вв. и их влияние на местное управление, земельные отношения и систему повинностей (ясак, подати) алтайского и местного русского крестьянского населения.
Результаты многолетней работы археологов и историков Института были обобщены в I-м томе «Истории Республики Алтай» (2002). В работе представлена история региона, начиная с древности и до вхождения в состав России в середине 50-х годов XVIII в. В подготовке монографии участвовали известные советские и российские ученые из других академических институтов: А.П. Деревянко, В.А. Моисеев и др.
Современный этап связан с переходом с 2008 года научно-исследовательской деятельности Института к программно-целевому методу планирования. На сегодняшний день группу истории представляют следующие сотрудники: Каташев М.С., кандидат исторических наук, Н.В. Екеев, кандидат исторических наук и Эшматова Г.Б., кандидат политических наук.
За последние 10 лет историки института издали ряд коллективных работ. В 2014 году издана коллективная работа «Очерки по новейшей истории Республики Алтай (1991-2010 годы.)», в которой в обобщенном виде показано развитие Республики Алтай по таким важным направлениям, как политическая система, экономика, социальная сфера, культура, общественно-политическая ситуация и этнические процессы. В 2015 году вышла коллективная монография «Религиозные деноминации в Республике Алтай», в которой рассматриваются религиозные организации, представляющие мировые религии на территории Республики Алтай и традиционные верования алтайцев. В 2017 году историки института издали коллективную монографию «Политические репрессии в Горном Алтае (1922–1953 гг.)». В книге рассмотрены основные направления репрессивной политики в отношении разных слоев населения: партийных и государственных служащих, интеллигенции, крестьянства, служителей религиозного культа. В 2020 году издана коллективная монография «Кочевники Горного Алтая в условиях социальных и экономических преобразований в России (вторая половина XVIII–середина XX вв.)». В издании показан длительный процесс включения и адаптации алтайского народа в составе российского, а затем и советского государства. Исследованы трансформационные процессы в среде кочевого и полукочевого населения в хозяйственной, культурной и бытовой сферах. Сотрудниками группы истории ведется подготовка к изданию коллективной монографии «История Республики Алтай. Том III (1917–1991 годы)». В ней будут показаны процессы в социально-экономической, демографической, общественно-политической, культурной сферах жизни Горного Алтая.
Помимо коллективных монографий группой историков подготовлены и изданы индивидуальные монографии: Э.Г. Эшматовой «Республика Алтай: этнополитические процессы и современный мир» (2011), М.С. Каташевым «Исторический опыт лесопромышленного освоения Горного Алтая в 1960-1980-е гг. Эколого-экономический аспект» (2013).
С 2022 г. группа историков осуществляет научно-исследовательскую работу по выполнению проекта «Республика Алтай в конце XX – начале XXI вв.: Власть. Экономика. Население. Культура». Научно-практическая значимость проекта заключается в изучении целостной картины исторического развития Республики Алтай за четверть века (1991–2016 гг.). Исследование носит комплексный характер, в проекте участвуют специалисты ряда гуманитарных дисциплин: историки, этнографы, политологи.
Одновременно ведется работа по публикации архивных документов по разным периодам истории Горного Алтая. Наиболее значимыми результатами работы сотрудников группы истории в этом направлении стало издание сборников архивных документов «Политические репрессии в Горном Алтае (1922–1953 гг.)» (2017) и «Михаил Васильевич Карамаев: жизнь и деятельность» (2019). В состав второго сборника вошли документы о социально-экономическом развитии Горно-Алтайской автономной области в период с середины 1950-х до конца 1980-х годов.
Сотрудники группы истории осуществляют исследования по исторической тематике путем привлечения грантов РГНФ/РФФИ.
Исследования по исторической тематике имеют практическую значимость: они используются в учебном процессе общеобразовательных школ, вузов и в просветительской работе. Историки также оказывают научные консультации органам исполнительной власти Республики Алтай, ведомствам и организациям.
Сотрудники группы истории ведут работу по организации и проведению научных мероприятий: «Национальный регион России в эпоху революционных преобразований и становления политической системы сталинизма. 1917–1939 гг. (на примере Ойротии – Горного Алтая)» (октябрь 1917 г.), круглый стол «Горный Алтай и горно-алтайцы в годы Великой Отечественной войны» (ноябрь 2020 г.) и др.
Результаты своих исследований ученые-историки апробируют на международных, российских, межрегиональных и региональных конференциях, издают научные статьи в базе РИНЦ и в журналах перечня ВАК.
